进入秋季，棉花生长转入吐絮、完成秋桃发育的生长后期，这个时期应以养根保叶为中心，以科学的管理手段，促棉株健壮生长，防止早衰及贪青晚熟和烂桃，争取棉花丰收，具体管理方法如下：
一、抗旱防涝
无水等于无肥，如果水分不足，棉株就会产生大量的乙烯，导致棉铃早衰和脱落，所以在8月中旬至9月中旬这一时期0～40厘米土壤含水量要保持在田间持水量的55%以上，只有这样棉花的各项生理功能才能正常运行。若低于这个指标就要浇小水或隔行浇水，切忌大水漫灌或浸泡，以保持棉田排水畅通，避免出现过多积水而影响根系活力。在防旱的同时也要注意秋雨过多对棉花造成的涝害，要及时做好清沟排水工作，以保养根系，减少烂铃。
二、中耕松土
雨后或浇水后的棉田，地面板结，通透性差，根系活力下降，可用畜力浅中耕或人工锄地（松土宜浅不宜深）来破除土壤板结，提高土壤的通透性，促进棉花根系生长，同时结合松土，进行培土壅根，可有效增强棉花的抗倒能力。
三、根外追肥
充分利用叶片的吸收功能，进行 叶 面 喷肥，以弥补根系吸收养料的不足，提高叶片的光合能力，从而提高棉花成铃率。重施花铃肥，以满足棉花结铃时对养分的需要；补施桃肥，棉花成桃时对钾肥需求量多，由于消耗了大量养分，不少棉田出现了缺肥早衰的现象，如不及时补充养分，难以实现秋桃盖顶；适时喷肥防早衰，8月至9月上旬，每隔5～6天，喷施一次1%的尿素水，重点喷施于中上部叶片背面，晴天在下午4点以后喷施，阴天可全天喷施，切忌在气温高、光照强时喷洒，以免喷后水分蒸发过快，浓度骤增出现烧叶现象。
四、及时整枝、推株并垄
主要是去除棉株下部老叶和空棉枝，并打掉棉枝群尖。对于枝叶繁茂、密度偏大的棉田还应在雨后趁土壤湿润时采取推株并垄的措施，即将相邻的两行棉花推并在一起，呈“八”字形，使并在一起的棉花两侧得到充足的阳光照射，起到通风透光、增温降湿的作用。
五、防止贪青晚熟
棉花生长后期因为群体过大、氮肥施用过多、过晚、棉株生长过旺易造成贪青晚熟，晚秋桃增多，导致棉桃不能正常开裂，影响棉花品质。对晚熟棉桃应喷施乙烯利溶液进行催熟，应在“寒露”至“霜降”前后、平均气温连续3天在20℃以上、80%以上棉铃达40天以上时喷施。
六、科学治虫防病
要重点做好黄叶枯死病、棉铃虫、棉蚜等病虫害的防治工作。黄叶枯死病是一种营养不良并伴以缺钾的一种生理性病害，棉田缺乏有机肥、瘠薄及干旱等都能发生此病，可采用补施钾肥及叶面喷肥的方法进行防治；棉蚜虫、棉铃虫等害虫都具有较强的抗药性，防治时注意混合用药和轮换用药。
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